Tes COVID-19 Terpadu: Deteksi, Lacak Varians & Co-Infeksi dalam Satu Prosedur

Strategi tes COVID-19 jenis baru dapat membantu menyederhanakan proses identifikasi kasus, pelacakan varian, dan deteksi virus coinfeksi. Saat ini, assay terpisah dan alur kerja yang kompleks terlibat dalam masing-masing dari ketiga prosedur diagnostik ini, dengan analisis biasanya dilakukan di fasilitas yang sangat spesialis. Peneliti sekarang telah menggabungkan semua jenis tes ini ke dalam satu prosedur yang seharusnya memungkinkan pelacakan titik layanan COVID-19 dan banyak varian baru dari SARS-CoV-2.

Tes ini melibatkan mini-laboratorium berukuran briefcase yang portable yang menghindari teknik lambat dan mahal yang standar untuk pemantauan dan pemeriksaan COVID-19. Tes ini memanfaatkan metode genetik (yang disebut recombinase polymerase amplification) dan sequencer portable untuk dengan cepat mendeteksi keberadaan sekuen virus dan memberikan readout hingga 96 sampel pasien sekaligus.

Tes ini dirancang untuk mendekode lima segmen genom SARS-CoV-2, masing-masing dipilih untuk membantu memandu pelacakan varian. Peneliti juga menggabungkan assay untuk tiga virus pernapasan umum yang dapat menyebabkan gejala serupa dengan COVID-19.

Tim memvalidasi teknik — yang disebut NIRVANA — menggunakan swab hidung dan tenggorokan dari orang yang diduga terinfeksi SARS-CoV-2. Mereka juga menguji sampel air limbah yang dikumpulkan dari sewage komunal untuk menunjukkan bagaimana metode ini dapat memungkinkan pengawasan tingkat populasi SARS-CoV-2 dan virus lain.

Salah satu keterbatasan tes ini adalah ia hanya dapat mendeteksi mutasi SARS-CoV-2 di wilayah genom yang dipilih dan seiring varian khawatir baru terus muncul di seluruh dunia, wilayah tersebut mungkin perlu diperbarui untuk mencerminkan natur yang berkembang virus.