Menggunakan Nanopartikel Magnetik Bermuatan Positif untuk Menangkap Bakteri pada Konsentrasi Sangat Rendah
Abstrak
Mendeteksi bakteri pada konsentrasi rendah tanpa proses kultur yang memakan waktu akan memungkinkan diagnosis yang cepat. Karena daya tarik elektrostatik ada antara sel bakteri bermuatan negatif dan nanopartikel magnetik bermuatan positif (NP+), penangkapan bakteri sangat menjanjikan untuk mencapai tujuan ini. Di sini, kami menyajikan pendekatan yang cepat dan sangat efisien untuk menangkap Escherichia coli , yang digunakan sebagai model untuk bakteri gram negatif. Penangkapan E. koli pada konsentrasi yang sangat rendah dari 10 dan 100 CFU/mL menggunakan NP+ dengan cepat dan efisien dicapai dalam 1 h. Selain itu, efisiensi penangkapan NP+ lebih dari 90% dengan menganalisis jumlah koloni bakteri pada cawan. Mikroskop elektron optik dan transmisi mengkonfirmasi kemampuan menangkap bakteri dari nanopartikel bermuatan listrik (NP). Sebaliknya, nanopartikel magnetik bermuatan negatif (NP−) tidak menunjukkan afinitas terhadap E. koli . Hasil ini menunjukkan bahwa sel bakteri, seperti E. koli , membawa muatan negatif. Tidak seperti sistem penangkapan yang bergantung pada ligan, NP+ kami yang dirancang memiliki potensi untuk menangkap berbagai bakteri melalui atraksi elektrostatik.
Latar Belakang
Penyakit menular adalah salah satu tantangan kesehatan paling mendesak di dunia. Kontaminasi mikroba pada sumber daya air merupakan ancaman utama bagi kesehatan masyarakat. Escherichia coli (E.coli ), bakteri gram negatif, sangat umum di air dan makanan yang terkontaminasi. Beberapa jenis E. koli bahkan dapat menyebabkan infeksi bakteri yang serius. Bakteri pada konsentrasi rendah sulit dideteksi dan biasanya memerlukan proses pra-pengayaan sebelum analisis lebih lanjut. Metode mikrobiologi berbasis kultur melelahkan dan mungkin memakan waktu beberapa hari. Selain itu, beberapa strain bakteri dapat memasuki keadaan yang layak tetapi tidak dapat dikultur di mana mereka dapat hidup tetapi tidak dapat dikultur pada agar-agar rutin, yang menghambat deteksi mereka dengan metode berbasis kultur [1]. Sebaliknya, penangkapan dan dekontaminasi bakteri patogen yang cepat dapat memberikan hasil waktu nyata untuk mengurangi wabah penyakit menular.
Berbagai bahan dikembangkan untuk menangkap dan menghilangkan bakteri secara cepat dari sumber yang terkontaminasi. Carbon nanotube dan resin-linked oligoacyllysine bead telah digunakan untuk menghilangkan bakteri dari air [2, 3]. Nanopartikel magnetik, yang dapat dengan mudah dipisahkan dari berbagai sumber daya dengan menggunakan proses magnetik, banyak digunakan untuk deteksi bakteri dan dekontaminasi setelah difungsikan dengan molekul organik [4,5,6]. Teknik berbasis magnet memiliki keunggulan dalam menangkap target dengan menghemat waktu (waktu pemisahan umum dalam 1 h), pemulihan tinggi, kemungkinan otomatisasi, dan pemisahan skala [7]. Efisiensi dan selektivitas pemisahan magnetik sangat tergantung pada ligan, tetapi terkadang sulit untuk mendapatkan ligan dengan afinitas dan spesifisitas yang tinggi terhadap target. Oleh karena itu, perlu dikembangkan sistem penangkapan bakteri dengan nanopartikel magnetik ligan-independen untuk menangkap bakteri, terutama pada konsentrasi rendah.
Banyak ilmuwan telah menyelidiki sifat muatan listrik bakteri. Bechhold (1904) adalah orang pertama yang menemukan fakta bahwa sel bakteri membawa muatan negatif [8]. Meskipun telah diketahui bahwa populasi besar sel bakteri cenderung mempertahankan muatan negatif, sedikit yang diketahui tentang elektrofisiologi bakteri pada tingkat sel tunggal. Pada tahun 2011, Cohen dkk. mengungkapkan lonjakan listrik di E. koli hingga 1 Hz menggunakan protein penunjuk tegangan fluoresen [9]. Karena banyak jenis dinding sel bakteri bermuatan negatif, nanopartikel bermuatan positif dapat berinteraksi kuat dengan spektrum bakteri yang luas melalui interaksi elektrostatik.
Untuk memanfaatkan nanopartikel magnetik dan muatan negatif masing-masing bakteri untuk deteksi patogen yang cepat, kami merancang sistem untuk menangkap bakteri dalam konsentrasi rendah. Nanopartikel magnetik bermuatan positif dibuat oleh polietilenimin (PEI), yang terdiri dari gugus amina yang melimpah. Kemudian kami menyelidiki afinitas nanopartikel yang difungsikan PEI terhadap E. koli . Metode inovatif ini memberikan pengikatan bakteri yang efisien melalui interaksi elektrostatik.
Bahan dan Metode
Nanomaterial
Besi (III) klorida hidrat (FeCl3 ·6H2 O), amonium hidroksida (NH4 OH, 28 wt%), asam klorida (37 wt% larutan berair), etilen glikol, dan natrium asetat dibeli dari Perusahaan Reagen Shanghai (Cina). Tetraethyl orthosilicate (TEOS), (3-aminopropyl) triethoxysilane (APTES), dan fluorescein tetramethylrhodamine (TRITC) dibeli dari Sigma-Aldrich (AS). Poli(etilena imina) bercabang (PEI, 99%, Mw =10.000) dibeli dari Alfa Aesar. Semua larutan disiapkan menggunakan air deionisasi Milli-Q (18,2 MΩ cm pada resistivitas 25 °C).
Sintesis NP
Biaya3 O4 nanopartikel disiapkan oleh reaksi solvothermal [10]. Secara singkat, 0,081 g FeCl3 ·6H2 O dilarutkan dalam 30 mL etilen glikol di bawah pengadukan magnetik. Kemudian, 0,3 g asam poliakrilat (PAA) dan 1,8 g urea ditambahkan ke dalam larutan ini. Setelah diaduk selama 30 menit, larutan dipanaskan pada suhu 200 °C selama 12 jam dengan menggunakan autoklaf baja tahan karat berlapis Teflon. Ketika didinginkan sampai suhu kamar, produk hitam, yaitu inti nanopartikel magnetik, dikumpulkan oleh magnet. Dilanjutkan dengan pencucian dengan etanol dan air deionisasi masing-masing tiga kali, Fe3 O4 nanopartikel diperlakukan dengan 0,15 M HCl di bawah sonikasi selama 15 min dan kemudian dilapisi dengan silika melalui hidrolisis dan TEOS.
Untuk mempersiapkan nanopartikel magnetik fluoresen bermuatan negatif (NP−), kompleks APTES-TRITC (C33H44N3O6Si) pertama kali direaksikan dalam kondisi gelap semalaman dalam etanol. Kompleks tersebut kemudian dicangkokkan ke Fe3 O4 nanopartikel melalui reaksi antara APTES dan gugus hidroksil pada Fe3 O4 @SiO2 partikel nano. Selanjutnya, 30 μL TEOS ditambahkan dan direaksikan selama 24 h dalam gelap. Diikuti dengan pencucian dengan etanol dan air deionisasi setiap tiga kali, NP− fluoresen dihasilkan. Melalui modifikasi NP− dengan polikation polimer PEI, nanopartikel magnetik bermuatan positif (NP+) selesai.
Karakterisasi NP
Studi mikroskop elektron transmisi (TEM) dilakukan oleh TECNAI F
− 30
mikroskop elektron transmisi resolusi tinggi yang beroperasi pada 300 kV. Ukuran partikel dan potensi zeta NP ditentukan oleh seri Malvern Zeta Sizer Nano (Westborough, MA). Fluoresensi diperiksa dengan mikroskop confocal pemindaian laser Carl Zeiss LSM5 EXITER (Zeiss, Jena, Jerman).
Persiapan Bakteri
Strain gram negatif E. koli BL21 digunakan sebagai bakteri model. E. koli dibudidayakan dalam 100 mL media pertumbuhan Luria Broth [11]. Bakteri dikultur dalam inkubator termostatik pada 200 rpm, 37 °C selama 16 h. Selanjutnya, 100 μL kultur bakteri dihilangkan, diencerkan dengan medium 1 × 10
5
kali, dilapisi pada agar-agar, dan dikultur pada 37 °C selama 24 h. Jumlah unit pembentuk koloni dihitung. Sel bakteri yang tersisa dipanen dengan sentrifugasi pada 5000 rpm selama 5 menit, dicuci tiga kali dengan 1× PBS (10 mM, pH 7.4), dan diencerkan hingga konsentrasi sekitar 1 × 10
3
unit pembentuk koloni (CFU)/mL. Untuk pertimbangan keamanan, semua sampel bakteri ditempatkan dalam autoklaf pada 121 °C selama 20 menit untuk membunuh bakteri sebelum dibuang dan semua peralatan gelas yang kontak dengan bakteri disterilkan sebelum dan sesudah digunakan.
Eksperimen Penangkapan Bakteri
Semua studi penangkapan batch dilakukan dalam buffer PBS 1x yang disterilkan. Empat puluh mikroliter NP (1 μg/μL) didispersikan dalam larutan garam steril di bawah ultrasonikasi selama 10 mnt, dan kemudian 1 mL larutan bakteri (kira-kira 10
3
CFU/mL) ditambahkan ke dalam suspensi. Setelah inkubasi 10 menit, bakteri yang terikat NP ditangkap melalui magnet permanen ke dinding vial, dan bakteri bebas dihilangkan dengan larutan pencuci. Bakteri yang ditangkap dilepaskan dengan melepas magnet dan disuspensikan kembali dalam PBS. Untuk analisis mikroskopis, alikuot bakteri disebarkan ke slide dan diwarnai dengan Hema-3 (Fisher Diagnostics). Untuk analisis imunofluoresensi, alikuot bakteri disebarkan ke slide dan diwarnai dengan 4′-6-diamidino-2-phenylindole (DAPI).
Efisiensi Penangkapan Bakteri NP pada Konsentrasi Berbeda
Satu mililiter suspensi bakteri (kira-kira 2 × 10
2
CFU/mL) diinkubasi dengan jumlah yang berbeda (5, 10, 20, 30, 40, 50, 75, dan 100 μg/mL) NP+ atau NP− selama 10 min. Setelah pemisahan magnetik oleh nanopartikel, larutan total kemudian diambil sampelnya dan dianalisis konsentrasi bakterinya melalui metode penghitungan pelat. Efisiensi penangkapan bakteri dari NP diuji dengan menghitung jumlah CFU pada pelat LB-agar.
Kemampuan NP untuk Menangkap Bakteri pada Konsentrasi Rendah
Empat puluh mikrogram NP+ atau NP− diinkubasi dengan 1 mL suspensi bakteri pada konsentrasi yang sangat rendah (10 dan 10
2
CFU/mL). Setelah pemisahan magnetik oleh nanopartikel, larutan total kemudian diambil sampelnya dan dianalisis konsentrasi bakterinya melalui metode penghitungan pelat. Efisiensi penangkapan bakteri dari NP diuji dengan menghitung jumlah CFU pada pelat LB-agar.
Analisis Statistik
Hasil dinyatakan sebagai mean ± standar deviasi (SD) seperti yang ditunjukkan pada legenda gambar. Analisis varians dua arah (ANOVA) dengan analisis hoc yang tepat dihitung menggunakan perangkat lunak GraphPad Prism dengan P nilai < 0,05 dianggap signifikan secara statistik.
Hasil
Karakterisasi NP Magnetik
Diagram skematik untuk persiapan nanopartikel komposit magnetik bermuatan permukaan ditampilkan pada Gambar. 1. Fe3 O4 nanopartikel terkonjugasi dengan APTES untuk membentuk lapisan tipis SiO2 cangkang pada permukaan nanopartikel pada reaksi dengan TEOS dan NH4 OH. Untuk memvisualisasikan dan mengukur sel yang ditangkap secara langsung, kompleks APTES-TRITC awalnya direaksikan, diikuti dengan pencangkokan ke permukaan Fe3 O4 @silika komposit melalui reaksi sol-gel klasik. Gugus SiOH yang melimpah mengatur keseluruhan permukaan produk ini, menunjukkan muatan permukaan negatif yang kuat, yaitu nanopartikel magnetik bermuatan negatif (NP−). Untuk nanopartikel magnetik bermuatan positif (NP+), molekul PEI digunakan untuk menutupi dan memodifikasi permukaan NP−. Produk yang dimodifikasi menunjukkan muatan permukaan positif yang kuat karena keberadaan gugus amina yang melimpah.